Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms