Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Colec12Q8K4Q8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec12Q8K4Q8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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