Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lin28aQ8K3Y3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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