Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vrk3Q8K3G5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms