Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Matr3Q8K310 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms