Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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