Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr3Q8K296 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr3Q8K296 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms