Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms