Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms