Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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