Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp27Q8CEG8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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