Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc15Q8C9M2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms