Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms