Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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