Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ssuh2Q8C3L1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ssuh2Q8C3L1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ssuh2Q8C3L1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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