Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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