Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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