Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms