Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik4Q8BMF5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms