Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Usp1Q8BJQ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Usp1Q8BJQ2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Usp1Q8BJQ2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Usp1Q8BJQ2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp1Q8BJQ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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