Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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