Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms