Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg2bQ80XK6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms