Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ell3Q80VR2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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