Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Avl9Q80U56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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