Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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