Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SynmQ70IV5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynmQ70IV5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms