Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfrkbQ6PIJ4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms