Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms