Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sv2cQ69ZS6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms