Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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