Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms