Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha6Q62413 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha6Q62413 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha6Q62413 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha6Q62413 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha6Q62413 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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