Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms