Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms