Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfap2bQ61313 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms