Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctf1Q60753 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms