Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms