Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprnQ60673 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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