Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms