Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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