Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms