Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Carmil2Q3V3V9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms