Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051142Q3V0M8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051142Q3V0M8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051142Q3V0M8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051142Q3V0M8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051142Q3V0M8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051142Q3V0M8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms