Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnpc3Q3UZ01 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms