Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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