Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms