Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms