Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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