Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms